(Los acentos fueron
obviados por cuestiones tecnicas)
La
forma de medir la relevancia de una web y de analizar una red de amigos ha
permitido descubrir biomarcadores para el diagnostico del cancer de pancreas
El
sistema que usa Google para medir la relevancia de una pagina web ha servido
a un grupo de investigadores alemanes para analizar 20.000 proteinas
relevantes para el cancer de pancreas. Tambien han imitado el algoritmo de
Facebook para descubrir sus interacciones y han encontrado que siete de
ellas son importantes en la progresion de esta enfermedad oncologica. Aunque
los biomarcadores encontrados parecen significar un avance en el diagnostico
del cancer de pancreas, todavia no se pueden aplicar a la practica clinica.
Como decide Google que paginas son las mas relevantes y la manera en la que
se relacionan los usuarios de Facebook son dos estrategias que se han
utilizado para encontrar proteinas clave en el desarrollo del cancer de
pancreas. Este es el resultado de una investigacion alemana que se publica
en la revista Plos Computational Biology.
Los cientificos de la Universidad de Dresde emplearon una modificacion del
algoritmo ‘PageRank’ de Google para testar la posible relevancia de 20.000
proteinas en el cancer de pancreas. El resultado es el hallazgo de siete
moleculas que pueden ayudar a determinar la agresividad del tumor y como de
intensa debe ser la quimioterapia que reciba el paciente.
“Hemos buscado marcadores teniendo en cuenta todas sus interacciones, es
decir, hemos fisgoneado en su red de ‘amigos”, explica a SINC Christof
Winter, bioinformatico y primer autor del estudio.
“La busqueda de biomarcadores de manera aislada daba muchos falsos
positivos”, aseguran los cientificos. Las proteinas que encontraban podian
predecir bien la progresion del cancer en una cohorte de pacientes pero no
en personas individuales. “Usando el algoritmo de Google y teniendo en
cuenta la red de interacciones de las proteinas nuestros resultados son
mucho mas reproducibles y aplicables a cada paciente”, afirma Winter.
Al
principio, el equipo experimento con sus propias estrategias de busqueda,
pero “pronto nos dimos cuenta de que el algoritmo que necesitabamos ya
existia”, comenta Winter. “Estaremos encantados de facilitar el codigo que
hemos utilizado y las instrucciones para activarlo a todo aquel que lo
necesite”, aseguran los investigadores.
La importancia de los biomarcadores
“En medicina buscamos biomarcadores en muestras de saliva, pelo y sangre de
los pacientes”, explica Winter. Estas moleculas permiten saber si una
persona esta enferma (marcadores diagnosticos o de deteccion temprana) y su
progresion (marcadores pronosticos).
“Casi todos los marcadores, en su sentido mas amplio, se pueden detectar en
un analisis de sangre estandar –señala el experto–. Pero desde hace una
decada los marcadores mas populares son los que medimos mediante tecnicas de
genomica y transcriptomica”.
Aunque los biomarcadores encontrados parecen significar un avance en el
diagnostico del cancer de pancreas, todavia no se pueden aplicar a la
practica clinica. “Queda mucho camino por recorrer si queremos transformar
estos descubrimientos en farmacos que detengan la progresion del cancer”,
comentan los autores.
El
grupo de Winter ya esta colaborando con RESprotec, una compañia
biotecnologica que trabaja en el desarrollo de nuevos medicamentos
relacionados con el cancer pancreatico.
Fuente:
Tendencias 21
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