Permitirá concretar cuál es el antibiótico óptimo para erradicar la infección
Un grupo de investigadores de la Universidad de
Oxford ha logrado implementar un programa de ordenador que permitirá
determinar, rápidamente, que antibióticos son los más apropiados para poder
combatir importantes infecciones intrahospitalarias. Esto evitaría tanto, la
ingesta de antibióticos ineficaces como, dosis innecesarias y por tanto, las
infecciones serían más fáciles y rápidas de eliminar.
Contaminación microbiana en una placa de agar. Fuente: AlphaGalileo.
En general, los pacientes que contraen infecciones
provocadas por bacterias denominadas habitualmente como fármacos resistentes
tienen un peor pronóstico en el desarrollo de su enfermedad y un mayor riesgo
de morir que las personas que están infectadas con bacterias de la misma
especie pero sin que sean resistentes a dichos fármacos.
Esto, como es evidente, supone un grave problema
para el control de estas infecciones. Por lo tanto, necesitamos con urgencia
nuevas estrategias de diagnóstico que permitan dar un mejor uso a los
antibióticos y, con ello, salvaguardar la eficacia tanto de los fármacos ya
existentes como de los nuevos que se desarrollen en un futuro.
Un grupo de investigadores pertenecientes al Centro
Wellcome Trust de Genética Humana de la Universidad de Oxford tal y como
describen en Nature Communications, ha logrado implementar un nuevo
programa de ordenador (Mykrobe Predictor) que posibilita el análisis
rápido del ADN bacteriano. Esto permite predecir cuáles serían los antibióticos
que mejor actuarían sobre dicha infección para poder combatirla y cuáles serían
los antibióticos frente a los que esas bacterias han generado resistencias.
¿En qué consiste el proceso?
Siempre hemos escuchado hablar de las infecciones
asociadas a las estancias hospitalarias (infecciones nosocomiales) que han
adquirido pacientes ingresados en hospitales. Sobre todo, cuando padecen
enfermedades que implican estancias largas o cuando se trata de pacientes que
se encuentran en la unidad de cuidados intensivos.
Tal es así, que cada año el tratamiento y la
alteración de pacientes en todo el mundo se complica a causa de infecciones
contraídas durante la asistencia médica. De hecho, algunas personas enferman más
gravemente por este tipo de infecciones hospitalarias que por las patologías
con las que fueron ingresados. Otras, en cambio, alargan su estancia en el
hospital y otras quedan discapacitadas por un largo período de tiempo o incluso
mueren.
Estas graves consecuencias podrían minimizarse,
según el equipo de investigación de Oxford, mediante el empleo del nuevo
software que este grupo ha desarrollado. Este programa diseñado por el Dr.
Zamin Iqbal y su equipo consiste en un programa de ordenador fácil de usar que
puede ejecutarse en un ordenador portátil estándar o tablet y puede ser
utilizado por una amplia variedad de profesionales sin experiencia en
bioinformática.
Para determinar qué cepa de bacteria está causando
la infección y frente a qué tipo de medicamentos es resistente, se llevan a
cabo una serie de pruebas de sensibilidad. Para ello, lo que se hace es
cultivar la bacteria que está provocando la infección en placas de cultivo.
Sobre ellas se añade una batería de antibióticos. Esto permitirá observar
cuáles de ellos han sido efectivos y, por tanto, han logrado eliminar o detener
el crecimiento de las bacterias. De este modo queda claro que antibiótico será
completamente efectivo.
Rapidez y efectividad en el proceso
El problema de todo el procedimiento descrito es el
tiempo. Es un proceso que puede tardar días o incluso meses, en función de la
rapidez o lentitud de crecimiento de las bacterias en las placas de cultivo.
Además, si la bacteria porta alguna mutación que confiera resistencia, no puede
ser detectada mediante esta tecnología.
Por lo que, los científicos consideran que podría
obtenerse gran cantidad de información, pero de forma más rápida, centrándose
directamente en la secuencia del ADN bacteriano. Ésta es una técnica que tiene
el potencial de transformar la forma de diagnosticar y tratar las infecciones
bacterianas en los hospitales. Es más concreta y con su aplicación es posible
la detección de posibles alteraciones genéticas responsables de las
resistencias generadas frente a los antibióticos.
Sin embargo, la interpretación de la información
genética obtenida requiere, a menudo, un gran potencial informático, así como,
de especialistas con experiencia en bioinformática. Por tanto, el tiempo
“perdido” en todo este proceso, puede ser causa de importantes fatalidades.
El software diseñado por este grupo de
investigación agiliza todo este proceso mediante la automatización de análisis
del genoma. Gestiona los datos obtenidos tras la secuenciación de una forma
rápida. Concretamente, en menos de 3 minutos genera un informe médico en el que
se muestran los resultados de una forma sencilla de entender y en un ordenador
portátil estándar. Esto les permite cotejar el genoma de la bacteria causante
de la infección con el de cepas anteriores, iniciándose así la búsqueda de
posibles mutaciones causantes de la resistencia.
Ventajas de Mycrobe predictor
Los investigadores realizaron el estudio en más de
4500 muestras de pacientes, en el que comprobaron que el Mykrome predictor
detectaba con precisión la resistencia a antibióticos en dos infecciones
bacterianas potencialmente mortales, una causada por la bacteria responsable de
infecciones nosocomiales (Staphylococcus aureus) y la otra la
responsable de la tuberculosis (Mycobacterium tuberculosis).
Una de las principales ventajas del programa es
que, incluso, puede identificar infecciones donde el cuerpo de un paciente
contiene una mezcla de bacterias formada por bacterias fármaco resistentes y
bacterias fármaco sensibles. Esto supone una enorme ventaja sobre las pruebas
convencionales, por ejemplo, para la detección de resistencia a fármacos de las
bacterias causantes de la tuberculosis, resistente por lo menos a cuatro de los
medicamentos básicos.
Todo esto trae consigo una mejora en la toma de
decisiones, ya que serán más específicas y adecuadas, lo que, repercute
directamente en la salud del paciente. De hecho, el software ya se está
probando en tres hospitales del Reino Unido para estudiar si pudiera ayudar a
acelerar el diagnóstico de las infecciones resistentes a los fármacos, lo que
orientaría a los médicos a realizar una mejor prescripción de antibióticos.
Ahora, uno de los principales retos es desarrollar
herramientas adecuadas para que se pueda desbloquear la información obtenida en
la secuenciación del ADN de una forma rápida y asequible. Por lo que el
objetivo final de este equipo es proporcionar información completa sobre un
patógeno dentro de las 24 horas de cultivo, vinculando esta información a una
base de datos nacional que permita el tratamiento específico y adecuado para la
eliminación de la infección de un paciente.
Referencia bibliográfica:
Bradley
P y col. Staphylococcus aureus and Mycobacterium tuberculosis. Nature
Communications (2015). DOI: 10.1038/ncomms10063.
Por Anabel Paramá.
Fuente: Tendencias 21
No hay comentarios.:
Publicar un comentario